メモ

• Extexded genetic codes(Wiki)
• コドン表の拡張についても言及された（こちら）
• 塩基３つ組とアミノ酸の対応がコドン表
• 分子レベルでは、塩基３つ組と aminoacyl tRNA synthetase とアミノ酸とが対応する
• もっと言うと、mRNA上の塩基３つ組(X)と、 aminoacyl tRNA synthetaseにおける塩基３つ組の認識部位(Y)と、 aminoacyl tRNA synthetaseにおけるアミノ酸認識部位(Z)と、アミノ酸(W)とが登場する
• X=Y=Z=Wという関係
• X=Y, Y=Z, Z=Wという３連結が、分子レベルでコドン対応の安定的保証とどういう関係にあるかと、暗号の「でき具合」と関係があるかもしれないし、それほど関係がないかもしれない
• その他
• アミノ酸の生体内存在形態による分類は、こちらの"Occurrence and functions in biochemistry"で。
  • コーディングアミノ酸
  • 標準的アミノ酸
  • タンパク質に含まれる〜ペプチヂル化されているアミノ酸
  • 天然アミノ酸
  • 生体アミノ酸
  • 遊離状態のみで存在するアミノ酸
• アミノ酸の機能による分類は
  • タンパク質の構造アミノ酸
  • タンパク質の翻訳後アミノ酸
  • 生理機能のある遊離アミノ酸
  • 代謝経路上のアミノ酸