論文Tropical Principal Component Analysis and its Application to Phylogenetics https://arxiv.org/pdf/1710.02682.pdf トロピカル演算と行列のトロピカル積とトロピカル行列式とグラフの最短距離計算 トロピカル演算,がある 行列の積にも同じように定義…

igraphはRとpythonで使えるグラフ理論パッケージ python(python3)をanaconcaでwindowsに入れて pip install python-igraph したものの、プロット機能が使えなくて難航 pycairoに依存しているということがわかり、そのためにcairoを入れる必要があったのでメ…

igraphパッケージではps,eps,pdf出力しようとすると、フォントのデフォルト指定(らしきもの)が邪魔をする エラー: postscript() デバイス中にフォントファミリ 'serif' は含まれていません こんなサイトもあって、postscript()関数の方でフォントファミリー…

グラフは多次元データ それを２次元に描くためにノードの位置を定める必要がある 定め方が「グラフレイアウト」 Rのigraphパッケージでは、いくつかのレイアウト関数があって、２次元座標を返してくれるのだが… その座標を「適切に」画面に配置するためのル…

酒のつまみに「鳥の湯引き」が出た 鶏肉の表面が白く固くなっている。タンパク質(など)が変性しているから Wikipediaからの引用 『生体高分子の変性（英語：Denaturation）とは、ポリマーの二次構造が破壊されることを言い、変性した核酸やタンパク質などの…