メモ２

• こちらからに、いわゆるコドン表があって、アミノ酸の化学的性質で色分けがしてある
• こちらでも紹介されているようにWikiにはコドン表をコドン「グラフ」にしてある
• グラフらしさを強調すればこんな感じ

• コドン表の方は、一片の長さが４の立方体を押しつぶして２次元に描いたもの
• じゃあ、これを３次元に描いて、アミノ酸の色でルービックキューブの一辺４的にするとどんな風に見えるのだろう
• キューブ表示とグラフ表示、何が同じで何が違う？
• どちらで描くにしても「４塩基の並び順」によって、「意味の見えやすさ」に違いが出る〜強調される意味に違いが出る
• 「３階層」の順序の影響を受けるのは、グラフ表示、影響を受けないのは、キューブ表示
• 「４塩基の並び順」にしろ「３階層の順序付け」にしろ「影響を受ける」ということは、「順序を変えて描いてみると『見えるべきものが見えやすくなる並び順』と『見えにくくなる並び順』とがあること」を意味する。「「・・やすい」と「・・・にくい」は『測度』だから、『統計量』で扱えて、ｐ値に落とす〜有意に配慮したデータの説明に役立つ」。これが結局400ページ使ってryamada本に書いたこと