pythonでigraphを使ってplotする

• igraphはRとpythonで使えるグラフ理論パッケージ
• python(python3)をanaconcaでwindowsに入れて pip install python-igraph したものの、プロット機能が使えなくて難航
• pycairoに依存しているということがわかり、そのためにcairoを入れる必要があったのでメモ
• こちら
• msysを入れて…とひと手間かけたが、結局、コマンドラインから

conda install pycairo

• とするだけでよいらしい
• 入れた結果

import igraph
g = igraph.Graph()
g.add_vertices(3)
g.add_edges([(0,1),(1,2)])
adj = g.get_adjacency()
g2 = igraph.Graph.Adjacency(adj.data) # adjはigraphパッケージ独特な Matrxiと言うクラスなので、そのデータ部分だけを取り出して、リストとした adj.dataをGraph.Adjacency()関数に渡す
igraph.plot(g2)
out = igraph.plot(g2)
out.show()
out.save(fname='out.pdf')