知識はきっかけ

• Rに便利な関数がある
• Rに便利なパッケージがある
• 一番の問題は、それがあるのかないのかを知らないこと
• 本書で紹介されているパッケージをほとんど使ったことがない(それなりにパッケージをたくさん使用したことがあるのに…)
  • 使用経験ありのパッケージ
    • e1071
    • MCMCpack
    • R2WinBUGS

Rパッケージガイドブック

• plyr
  • 集合演算
• caret
  • 統計解析の手法発表論文のデータが得られる
• memisc
  • SPSSのデータ管理機能を補完
• bigmemory
  • 大規模行列を扱うため
  • 物理メモリを超える亮のデータを管理・使用
  • メモリマッピング
• snow
  • 並列処理
• DBI, RMySQL,RPostgreSQL,RSQLite,ROracle
  • DBMS(データマネジメントシステム)との連携
• Epi
  • Epidemiology(疫学)
• epicalc
  • 疫学計算機
• DCluster
  • 疾病の地域集積性
• diseasemapping
  • 疾病地図
  • こちらとか？
• survival
  • 生存時間解析
• RTisean, tseriesChaos
  • カオス力学系
  • 決定論的時系列解析
  • アトラクタ再構成
• plm
  • パネルデータ解析(クロスセクションデータを時系列に蓄積したデータの解析)
• xts
  • Extensible Time Series
  • 時系列処理、柔軟
• e1071
  • 雑多な関数群
    • こういうのが曲者だ
    • たとえば、"Functions for latent class analysis, short time Fourier transform, fuzzy clustering, support vector machines, shortest path computation, bagged clustering, naive Bayes classifier, ..."とある
• MCMCpack
  • MCMC、ベイズ推定
• R2WinBUGS
  • WinBUGSはBayesian inference Using Gibbs SamplinのWinプラットフォーム。それを使えるようにする
• coda
  • MCMC分析と診断
• KFAS
  • カルマンフィルタ、状態平滑化、攪乱項平滑化、シミュレーション平滑化、状態空間モデルの予測とシミュレーション
• randomForest
  • Random Forest
• pvclust
  • 階層的クラスタリングの結果の信頼性評価
• foreign
  • 他のソフトフェアの形式のデータの入出力
• rpart, mvpart
  • 再帰分割回帰木、多変量回帰木
• psych
  • 心理学
• sem
  • 構造方程式モデリング(心理学分野？)
• nnet
  • 単純パーセプロトンのフィード・フォワード型ニューラルネットワークと多項ロジスティック回帰
• som
  • 自己組織化マップ
  • 遺伝子のクラスタリング(アレイデータとか？)
• kknn
  • k近傍法による分類と回帰
• spgrass6
  • 地理情報システムGRASSとの連携
• maptools
  • 地図系
• rgdal
  • 地理空抽象ライブラリ
• RFinanceYJ
  • Yahooファイナンスからのデータ取得!
• ccgarch
  • 金融時系列、多変量GARCHモデル
  • 条件付相関係数・条件付共分散行列
• Rsolnp
  • 非線形計画問題(非線形な性医薬条件下で非線形な目的関数を最適化)
• Rmetrics
  • 金融工学・軽量経済学
  • 時系列・単位根検定、GARCHモデル、極値理論、コピュラ、デリバティブ・プライシング、ポートフォリオ解析
• glmnet
  • 一般化線形回帰
  • Lasso,Elastic-net
• systemfit
  • 計量経済分析
  • 線形・非線形の方程式体系の推定
• gmm
  • 一般化モーメント法、一般化経験尤度法
• ggplot2
  • 基本グラフィクスとトレリスグラフィクスの融合
• diagram
  • グラフ・ネットワークモデルを状態推移図・フローダイアグラムを用いて視覚化
• rtiff
  • TIFF画像のハンドリング
• XML
  • XML,HTMLのハンドリング
• twitterR
  • Twitterクライアント機能…
• Rcurl
  • HTTP, FTPなどのネットワークプロトコルのＲ用インターフェース
• Rpad
  • WebブラウザからＲを使うため
  • 「操作説明が必要ない、授業ごとの専用教材」が作れる！？本当に？
• xtable
  • ＲオブジェクトからLATEX形式、HTML形式の表を作成
• statconnDCOM
  • R言語用の外部COMサーバインターフェース(自分でやると、多分、挫折する)
• rcom
  • COMによるクライアントインターフェースと内部ＣＯＭサーバインターフェースを提供…(自分でやると、多分、挫折する)
• R AnalyticFlow
  • GUIで解析…