2010-07-30から1日間の記事一覧

BioPython

FASTQファイルをFASTAに変換 import sys from Bio import SeqIO SeqIO.convert(sys.argv[1], "fastq", sys.argv[2], "fasta") BioPython has a wiki and its article on SeqIO is here by RY for P-R-N meeting

ベクトルへのデータ格納

R

sampleを使うか、先に長いベクトルを作っておくと速いですね。################################################## #sample関数 jan system.time( for(i in 1:1000){ a } )#長いベクトルを作成 b system.time( for(i in 1:1000){ for(i in 1:100){ b[i] } }…