2005-10-20から1日間の記事一覧

5 均一多数回試行の割り振りによる並列処理

では、実際に簡単な並列処理をしてみる。一番簡単なのは niter回の繰り返し処理を nslave個のslavesに 割り振ることだろう Rmpi,snowを読み込む > library(Rmpi) > library(snow) 繰り返し処理としては、単純なものとして、2値(arg1,arg2)をとって、その入…

4 snow Rのクラスタハンドリングパッケージ

koiti_yano氏の記事をなぞる Rのパッケージ snow_0.2-1.tar.gzの入手 インストール # R CMD INSTALL snow_0.2-1.tar.gz * Installing *source* package 'snow' ... ** R ** inst ** help >>> Building/Updating help pages for package 'snow' Formats: text…

付 SPRNG,rsprngのインストール

Rにてsprngを動かすためのパッケージ rsprng (サイトはここ)のインストールが必要。その前段階として、Linuxでsprngが動くことが必要。そのパッケージがsprng2.0(サイトはここ)。 マルチプラットフォーム対応でLinuxにも対応しているはずだが、コンパイラエ…

Rの並列処理を目標にする

以前、PCクラスタに手を染めるための記事を書いた。RのWikiにRでの並列処理のページも出てきた。ひとまずの目標は、小規模クラスタを組んで、Rの単体マシンのプログラムを並列処理させてみることとする。まずは、ハードの勉強かと。 追記(2005/11/23)本…

3 LAM Rmpiが入ったところで動作確認

lamをとめて、ブートして、Rを立ち上げて、Rmpiパッケージを読み込んで、Rmpiの関数をいくつか使って、それぞれを閉じて、Rも閉じて、lamも止めている。途中Rmpiパッケージを読み込んだところで、エラー "rsprng package is not installed. Cannot use SPR…

2 Rmpiのインストール

Rmpiのインストール パッケージ Rmpi_0.4-9.tar.gzの入手 パッケージのインストール。コマンドとともにざーっとインストール画面が現れて終了 # R CMD INSTALL Rmpi_0.4-9.tar.gz * Installing *source* package 'Rmpi' ... Try to find mpi.h ... checking …

1 LMPのインストール

LMPのインストール マシン環境(Linux単体) PowerEdge 1600SC TurboLinux Server 8 この記事に沿って実施 lam-7.1.1.tar.gzを入手 /usr/local/bin/にインストール 動作確認 一般ユーザでユーザホームディレクトリにて、koiti_yano氏のこの記事に沿ってインス…